腎髄質には、肉眼的に2層が区別されます。より皮質に近い部分は髄質外帯と呼ばれ、血管に富んでいるため赤色を帯びています。これに対し、より内部の髄質内帯は、集合管と細い尿細管に富み、色は灰色です。時には髄質外帯をさらに外層と内層に分けることがあります。これらの層構造は、その中に局在する尿細管および血管の形態学的・機能的差異を反映しています。