会陰動脈は、下直腸動脈より腹側で本幹から分岐し、浅会陰横筋の上または下を通り、球海綿体筋と坐骨海綿体筋の間を進んで、これらに筋枝を与えた後、数本の後陰嚢枝（♂）または後陰唇枝（♀）に分岐し、これらの皮膚に分布します。